Hierarchy For Package de.unibi.techfak.jpredictor.motifs

Package Hierarchies:

All Packages

Class Hierarchy

• java.lang.Object
  • java.util.AbstractCollection<E> (implements java.util.Collection<E>)
    • java.util.AbstractList<E> (implements java.util.List<E>)
      • java.util.Vector<E> (implements java.lang.Cloneable, java.util.List<E>, java.util.RandomAccess, java.io.Serializable)
        • de.unibi.techfak.jpredictor.motifs.MotifList
  • de.unibi.techfak.jpredictor.motifs.FoundMotifStruct (implements java.lang.Cloneable, java.lang.Comparable<T>)
  • de.unibi.techfak.jpredictor.motifs.MotifFilter
  • de.unibi.techfak.jpredictor.motifs.MotifSearchAdapter (implements de.unibi.techfak.jpredictor.motifs.MotifSearcher)
    • de.unibi.techfak.jpredictor.motifs.Motif (implements java.lang.Cloneable, java.lang.Comparable<T>, de.unibi.techfak.misc.Markable, de.unibi.techfak.jpredictor.motifs.SequenceWindowScorer)
      • de.unibi.techfak.jpredictor.motifs.MultiMotif
        • de.unibi.techfak.jpredictor.motifs.DoubleMotif
      • de.unibi.techfak.jpredictor.motifs.PSPMotif (implements de.unibi.techfak.jpredictor.motifs.MotifSearchWithThreshold)
        • de.unibi.techfak.jpredictor.motifs.PSSMotif
      • de.unibi.techfak.jpredictor.motifs.RegularExpressionMotif (implements de.unibi.techfak.jpredictor.motifs.MotifSearchWithError)
        • de.unibi.techfak.jpredictor.motifs.SequenceMotif
  • de.unibi.techfak.jpredictor.motifs.MotifSearchAdapter.SearchFields
  • java.lang.Throwable (implements java.io.Serializable)
    • java.lang.Exception
      • java.lang.RuntimeException
        • de.unibi.techfak.jpredictor.motifs.CycleInMultiMotifExeption
        • de.unibi.techfak.jpredictor.motifs.MissingCharSequenceException
        • de.unibi.techfak.jpredictor.motifs.MissingMotifException
        • de.unibi.techfak.jpredictor.motifs.MotifNotCompleteException

Interface Hierarchy

• de.unibi.techfak.jpredictor.motifs.MotifSearcher
  • de.unibi.techfak.jpredictor.motifs.MotifSearchWithError
  • de.unibi.techfak.jpredictor.motifs.MotifSearchWithThreshold
  • de.unibi.techfak.jpredictor.motifs.SequenceWindowScorer